A história de Ayashi no Ceres tem como protagonista a jovem Aya Mikage e seu irmão gêmeo que em seu 16º aniversário descobre que são a reencarnação de uma lenda celestial. Ela seria a reencarnação de Ceres(uma Tennyo) e seu irmão, Aki Mikage seria a reencarnação do antigo marido de Ceres. Um grande problema surge pois a família Mikage acredita que a presença de uma Tennyo traria destruição à todos como desculpa para capturar Aya, pois na verdade eles queriam roubar o poder da Ceres para benefício próprio. Aya consegue fugir despertando a Ceres dentro de si, e em seguida sai em busca do Hagoromo de Ceres,para que ela possa voltar ao céu. No caminho faz amigos para alcançar seus objetivos.